该车的动力改装上，一如过去所有的JUN厂车般，是极为耀眼的其中一个项目。首先，VQ35DE引擎的排气量被增加至3772cc，也就是俗称的3.8L，排气量的增大是通过更换活塞、连杆、曲轴实现的，这套3.8L套件并非专门为这台厂车准备而特别生产的，早在2005年，JUN已经将这套套件推出市场，在国外也有不少的改装案例。此次，在增加至3.8L的基础上，该搭配被再次升级，除了基本的活塞（COSWORTH代工的95.7mm制品）、活塞采用降低压缩比的凹面式设计，配合连杆和曲轴后，引擎压缩比只有8.4:1，足以令VQ38DETT获得更佳的增压反应；I型断面连杆，并经过特殊的偷轻作业，活塞行程为87.4mm（原装为81.4mm）；JUN的高转平衡曲轴，除了配合了增加了的活塞行程外，还进行了高转速的平衡，以提高高转时的稳定性，相信不少用过JUN套件的WRX车主已经深有体会。当然，除了这些主要项目外，中缸部分的改动绝对不止这些，例如水道强化、机油泵、重新设计的油底壳等等。
因为要容纳前方的传动系统和布置特殊的油底壳，所以整颗引擎的安装高度略有提升，不过改装的完整度非常高，各种功能构件的布置相当合理。
缸盖部分的改装自然也需要配合，毕竟一台自然吸气引擎改涡轮增压，缸盖是关键。之前的3.8L套件内并没有高角度凸轮轴项目，但为了这台350Z-R，JUN特别制作了四条272度的高角度产品，更因为采用了凹型活塞，所以一并将气门升程提升至10.8mm，配合加大了的气门和气门座圈，气门顶塞和气门弹簧也被换掉。为了更好地控制气门开合时间、进气量和点火时间，JUN将VQ35DE上的连续可变气门正时系统（CVVT）拆去。负责增压的部分：涡轮增压器，一如过去JUN最喜欢的品牌：TRUST，两颗由三菱代工的TD05H涡轮被安放于引擎之后，虽然VQ采用V缸布置，但为了缩短进气段的长度，和排气的合理性，JUN将两颗对置地安放于引擎之后，并特别在头盖上制作出特殊的进气道为涡轮供应新鲜空气。增压值控制器由Greddy e-01负责，至于引擎的整体控制部分，则交由HKS F-Con V Pro 3.24版负责。
TRUST交由三菱代工的TD05H涡轮，在业界深受好评，单颗可对应450匹左右的输出，350Z-R用上它，主要为了提升整体涡轮反应。
引擎舱盖上留出了专门的进气道设计为引擎提供新鲜空气。
特别定制的铝合金风管，取其重量轻、散热快等优点，注意，经过涡轮压缩后的管道较细，但流速快；经过中冷器之后的气体体积增大，流速也较慢。
因为要配合特别的冷却系统布局，前空力套件由JUN自己一手包办。
下方管道为进气，出气在上，这样可令流速较快的压缩气体到达中冷器的时间与流速较慢经过冷却的气体流出中冷基本保持平衡，保证了节气门前有源源不断的气体供应。中冷器来自TRUST，但这样的布局较为特殊，所以JUN进行了修改才能获得如此模样。
原装的VQ35DE采用单颗式的电子节气门设计，作为一分为二的进气系统，只能流用其他车型的产品（240SX），但估计内径已经修改，估计超过65mm，毕竟原装的60mm根本不可能对应超越400匹以上的出风量。两个节气门间采用硬轴连接，以保证两个节气门间的开启时间和角度一致。
JUN的进气歧管集气箱是很知名的产品，在众多重度改装车中都能见到，其作用只有一个，就是为了各个气缸间的进气量保持一致，特别是大马力增压引擎对此项目尤为重视。
网络上的图片，可以看到整个进气歧管装置的布局，左方的节气门牺牲了节气门位置传感器，换上了硬轴联动系统；右方的节气门没有的拉线装置，但有位置传感器。65mm的节气门直径是笔者估计的，因为60mm不够用，而原装下一般扩径不能超过5～8mm。
左右管道间设置了联通管，以保证两排气缸的进气压力平衡，从而提高引擎畅顺度，这样的设计可以经常在那些超级跑车上见到。
已经被取消掉的CVVT系统。
大马力增压引擎的供油系统的关键性，过去也经常会提及。在这台350Z-R上有如艺术品，由原装燃油箱内的原装油泵将燃油送入SARD的副油箱，之后由两颗BOSCH 280L/M油泵供油分别将燃油输送至两边气缸前的1000cc喷油嘴（SARD）使用，“见光”部分的燃油管全部使用铝合金耐压管，有别于过去常见的钢丝外套油管。最后由SARD的燃油压力调整阀将燃油降压后回流副油箱，从而完成了整个供油过程。
引擎冷却部分，JUN采用了较为特殊的布局方式：空气从前保险杠的中央气道进入，经过斜向上的气道，上平面为两个机油冷却器、气道下底面为水箱。对于这样的布局，冷却的重点在机油冷却系统上，但是根据流体力学的原理，斜置式的水箱并不能有效地让空气流过，特别是那些厚度大的铝合金水箱，会因为散热网的气阻令空气难以穿越，降低了冷却效果。如果在此等专为赛道而生的高速赛车上还较为容易解决，但是如果是那些水箱前还有空调散热网的街车而言，水箱的冷却效能会更低。
整个风道设计如正梯型布局，下底边是水箱，除非有强力气流在水箱后长时间抽吸空气，不让大部分流体会集中冷却了机油冷却器。
装上保险杠后的进气道。
JUN自制的副水箱。
不要以为普利司通只出轮胎，其实他们是橡胶制品公司，产品涉及方方面面。
也是JUN自制的机油透气壶。